Δίνουμε εδώ τον πίνακα όλων των βιβλίων που έχει συγγράψει ο Karheinz Deschner, μαζί με το έτος της πρώτης κυκλοφορίας καθενός. Με λοξά γράμματα αναφέρονται συλλογικές εκδόσεις, στις οποίες περιέχονται κείμενά του.
1956 Die Nacht steht um mein Haus. Roman- 1957 Was halten Sie vom Christentum? 18 Antworten auf eine Umfrage
- 1957 Kitsch, Konvention und Kunst. Eine literarische Streitschrift
- 1958 Florenz ohne Sonne. Roman
- 1962 Abermals krähte der Hahn. Eine kritische Kirchengeschichte von den Anfängen bis zu Pius XII.
- 1964 Talente, Dichter, Dilettanten. Überschätzte und unterschätzte Werke in der deutschen Literatur der Gegenwart
- 1965 Mit Gott und den Faschisten. Der Vatikan im Bunde mit Mussolini, Franco, Hitler und Pavelic
- 1966 Jesusbilder in theologischer Sicht
- 1966 Das Jahrhundert der Barbarei
- 1968 Wer lehrt an deutschen Universitäten?
- 1968 Kirche und Faschismus
- 1969 Das Christentum im Urteil seiner Gegner, Band 1
- 1970 Warum ich aus der Kirche ausgetreten bin
- 1970 Kirche und Krieg. Der christliche Weg zum Ewigen Leben
- 1971 Der manipulierte Glaube. Eine Kritik der christlichen Dogmen
- 1971 Das Christentum im Urteil seiner Gegner, Band 2
- 1974 Das Kreuz mit der Kirche. Eine Sexualgeschichte des Christentums
- 1974 Kirche des Un-Heils. Argumente um Konsequenzen zu ziehen
- 1977 Warum ich Christ/Atheist/Agnostiker bin
- 1981 Ein Papst reist zum Tatort. Flugschrift
- 1982 Ein Jahrhundert Heilsgeschichte. Die Politik der Päpste im Zeitalter der Weltkriege, Band 1
- 1983 Ein Jahrhundert Heilsgeschichte. Die Politik der Päpste im Zeitalter der Weltkriege, Band 2
- 1985 Nur Lebendiges schwimmt gegen den Strom. Aphorismen
- 1986 Die beleidigte Kirche oder Wer stört den öffentlichen Frieden? Gutachten im Bochumer § 166-Prozeß
- 1986 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 1: Die Frühzeit - Von den Ursprüngen im Alten Testament bis zum Tod des hl. Augustinus (430)
- «Meine Skepsis bewahrt mich davor, Fanatiker zu werden – wovor noch kein Glaube geschützt hat.»
- 1987 Opus Diaboli. Fünfzehn unversöhnliche Essays über die Arbeit im Weinberg des Herrn
- 1988 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 2: Die Spätantike - Von den katholischen «Kinderkaisern» bis zur Ausrottung der arianischen Wandalen und Ostgoten unter Justinian I.
- 1989 Dornröschenträume und Stallgeruch. Über Franken, die Landschaft meines Lebens
- 1990 Woran ich glaube
- 1990 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 3: Die Alte Kirche – Fälschung, Verdummung, Ausbeutung, Vernichtung
- 1991 Die Politik der Päpste im 20. Jahrhundert
- 1991 Der Anti-Katechismus. 200 Gründe gegen die Kirchen und für die Welt (mit Horst Herrmann)
- 1992 Der Moloch. Zur Amerikanisierung der Welt
- 1994 Die Vertreter Gottes. Eine Geschichte der Päpste im 20. Jahrhundert
- 1994 Ärgernisse. Aphorismen
- 1994 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 4: Frühmittelalter - Von König Chlodwig I. (um 500) bis zum Tode Karls «des Großen» (814)
- 1994 Was ich denke
1995 Weltkrieg der Religionen. Der ewige Kreuzzug auf dem Balkan (mit Milan Petrovic)- 1997 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 5: 9. und 10. Jahrhundert – Von Ludwig dem Frommen (814) bis zum Tode Ottos III. (1002)
- 1997 Oben ohne. Für einen götterlosen Himmel und eine priesterfreie Welt. Zweiundzwanzig Attacken, Repliken und andere starke Stücke
- 1998 Die Rhön. Heidnisches und Heiliges einer einsamen Landschaft
- 1998 Für einen Bissen Fleisch. Das schwärzeste aller Verbrechen
- 1999 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 6: 11. und 12. Jahrhundert – Von Kaiser Heinrich II., dem «Heiligen» (1002) bis zum Ende des Dritten Kreuzzugs (1192)
- 1999 Zwischen Kniefall und Verdammung. Robert Mächler – Ein gläubiger Antichrist
- 1999 Memento! Kleiner Denkzettel zum «Großen Bußakt» des Papstes im Heiligen Jahr 2000
- 2002 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 7: Das 13. und 14. Jahrhundert – Von Kaiser Heinrich VI. (1190) zu Kaiser Ludwig IV. dem Bayern (†1347)
- 2003 Mörder machen Geschichte. Aphorismen
- 2003 Musik des Vergessens. Über Landschaft, Leben und Tod im Hauptwerk Hans Henny Jahnns
- 2004 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 8: Das 15. und 16. Jahrhundert – Vom Exil der Päpste in Avignon bis zum Augsburger Religionsfrieden
- 2007 Poeten und Schaumschläger. Von Jean Paul bis Enzensberger.
- 24 Aufsätze zur Literatur und Literaturkritik. Mit einem Vorwort von Ludger Lütkehaus
- 2008 Kriminalgeschichte des Christentums, Band 9: Mitte des 16. bis Anfang des 18. Jahrhunderts – Vom Völkermord in der Neuen Welt bis zum Beginn der Aufklärung
